Mistrzem Paragwaju został klub Club Olimpia, natomiast wicemistrzem Paragwaju – Cerro Porteño.
Sezon podzielony został na dwa turnieje – Apertura i Clausura. Zwycięzcy obu turniejów mieli zmierzyć się o mistrzostwo kraju, a zwycięzca miał zdobyć tytuł mistrza, natomiast przegrany tytuł wicemistrza Paragwaju.
Do turniejów międzynarodowych zakwalifikowały się następujące kluby: Copa Mercosur 1999: Cerro Porteño, Club Olimpia Copa Libertadores 2000: Club Olimpia, Cerro Porteño i Atlético Colegiales
Do drugiej ligi spadły dwa kluby – Club Presidente Hayes i Resistencia SC. Na ich miejsce z drugiej ligi awansował klub Universal Encarnación. Liga została zmniejszona z 11 do 10 klubów.
Torneo Apertura 1999 Apertura 1 Mecze 1-4 lutego 1999Cerro Porteño – 12 de Octubre Itaugua 1:1Sportivo San Lorenzo – Atlético Colegiales 5:2Club Presidente Hayes – Club Sol de América 0:2Sportivo Luqueño – Resistencia SC 4:2Club Olimpia – Club Guaraní 2:2
Apertura 2 MeczClub Olimpia – 12 de Octubre Itaugua 5:1Cerro Corá Asunción – Atlético Colegiales 2:2Club Guaraní – Club Presidente Hayes 3:2Resistencia SC – Club Sol de América 1:2Sportivo Luqueño – Sportivo San Lorenzo 3:1