Może być powiększona o cła, podatki, opłaty oraz inne należności związane z nabyciem towaru z wyłączeniem podatku VAT. Zgodnie z powstałym obowiązkiem podatkowym podatnik może obniżyć kwotę podatku należnego o kwotę podatku naliczonego, co sprawia że w ogólnym rozrachunku podatek jest neutralny. Transakcja WNT musi być wykazana w deklaracji JPK_V7M lub JPK_V7K, pliku JPK oraz w deklaracji VAT UE.
Rozliczenie WNT zgodnie z ustawą o VAT przez podatnika zwolnionego z VAT. Jeżeli nabywcą towarów w ramach WNT jest podatnik zwolniony z VAT ze względu na obroty, to nie wystąpi u niego WNT, jeżeli w danym roku podatkowym całkowita wartość WNT nie przekroczyła kwoty 50 000,00 zł. Zgodnie z powyższym podatnik nie rozlicza WNT. Nie musi się on także rejestrować na potrzeby rozliczania transakcji unijnych (VAT UE). Po przekroczeniu progu 50 000,00 zł podatnik zobligowany jest do zarejestrowania się do VAT UE, musi składać deklarację VAT-8 oraz informację podsumowującą – deklaracja VAT UE.
Rozliczeni WNT a CIT/PIT. Poniesione wydatki na zakup towarów handlowych od kontrahenta z innego kraju UE wykazywane są w kosztach uzyskania przychodów w taki sam sposób jak zakup od kontrahenta krajowego: