Oba strajki przyczyniły się do spadku popularności sportu. Wzrost zainteresowania footballem amerykańskim, koszykówką, a przede wszystkim gwałtownie rozprzestrzeniającym się hokejem, spowodował utratę kibiców przez wiele drużyn. W XXI wiek baseball wkroczył z problemami strukturalnymi, ciągle jednak pozostając jedną z czterech najpopularniejszych gier zespołowych Ameryki Północnej.
Baseball był sześć razy konkurencją pokazową podczas Igrzysk Olimpijskich. W 1992 roku podczas IO w Barcelonie dołączył do stałego programu zawodów. W latach 1992–2008 rozegrano pięć oficjalnych turniejów olimpijskich. Trzy razy mistrzami olimpijskimi zostali Kubańczycy (w 1992, 1996 i 2004), raz Amerykanie (w 2000) i Koreańczycy (w 2008). W 2005 MKOl zdecydował skreślić baseball i softball z oficjalnego programu igrzysk, uzasadniając decyzję między innymi absencją zawodowych graczy, występujących w lidze MLB. Do olimpijskiego programu baseball powrócił na igrzyska w Tokio, które odbyły się w 2021 roku, a turniej wygrali Japończycy. Na sesji Międzynarodowego Komitetu Olimpijskiego zorganizowanej w 2023 roku w Bombaju podjęto decyzję o włączeniu baseballu do programu Igrzysk Olimpijskich w Los Angeles w 2028.