Przebudowie poddano również system sklepień. W nawach bocznych wcześniejsze sklepienia gwiaździste zastąpiono sklepieniami sieciowymi, odpowiadającymi nowemu, regularniejszemu podziałowi wnętrza. W ramach regotycyzacji odnowiono lub wykonano na nowo liczne elementy kamieniarki oraz dekoracji architektonicznej, w tym rzeźby, rzygacze i pinakle.Dóm sv. Alžbety, História, sekcja „1877–1896 – Veľká rekonštrukcia”, oficjalna strona katedry, dostęp 31 sierpnia 2026.
Istotnej ingerencji poddano także zachodnią emporę. Późnogotycka empora, powstała około połowy XV wieku, została w 1895 roku całkowicie rozebrana podczas prac restauracyjnych. Jej zachowane elementy kamienne nabył hrabia Johann Nepomuk Wilczek, który wykorzystał je przy wznoszeniu zamku Kreuzenstein pod Wiedniem. Zrekonstruowana tam arkadowa konstrukcja zachodniej empory katedry znana jest jako Kaschauer Domgang lub Kaschauer Gang.
Podczas restauracji rozebrano także znajdującą się przy katedrze późnogotycką kaplicę św. Józefa, wzniesioną w drugiej połowie XV wieku. Była ona jedną z kilku kaplic dobudowanych do zasadniczego korpusu kościoła w końcowych fazach jego średniowiecznej rozbudowy.Dóm sv.