W sezonie 1998/1999 wystąpił w 4 meczach ligowych klubu z Kaiserslautern (w meczu z Bayerem 04 Leverkusen otrzymał czerwoną kartkę), a także w 3 meczach Ligi Mistrzów (z HJK Helsinki, PSV Eindhoven oraz Benfiką Lizbona). Kaiserslautern odpadło jednak w ćwierćfinale po klęsce z Bayernem Monachium (0:2 0:4).
Latem 1999 Ojigwe odszedł z Kaiserslautern do drugoligowego 1. FC Köln. Tam stał się podstawowym zawodnikiem zespołu. Brał udział w 32 meczach, w których zdobył 2 gole (oba w wygranym 6:3 meczu z FC St. Pauli). Został wybrany Najlepszym Defensywnym Pomocnikiem 2. Bundesligi i przyczynił się w wygraniu przez zespół z Kolonii ligi i awansie do ekstraklasy.
W lipcu 2000 Bayer Leverkusen zapłacił za Ojigwe 1,85 miliona dolarów i Pascal przeniósł się do zespołu "Aptekarzy". W lidze w barwach Bayeru zadebiutował w 5. kolejce, 16 września w przegranym 1:2 domowym meczu z Hansą Rostock. Ogólnie w całym sezonie zagrał łącznie w 11 meczach, a Leverkusen zajęło 4. miejsce. W sezonie 2001/2002 wywalczył z zespołem wicemistrzostwo Niemiec oraz dotarł do finału Ligi Mistrzów, gdzie niemiecki klub przegrał z Realem Madryt 1:2. W lidze zagrał w 3 meczach, a w Lidze Mistrzów w 4 grupowych, za każdym razem wchodząc na boisko jako rezerwowy. W sezonie 2002/2003 grał już więcej (16 meczów), ale Leverkusen zajęło 15.