Trzeci serial, zatytułowany Sonic Underground, wyemitowany został w 1999 roku i przedstawia Sonica oraz jego rodzeństwo – Sonię i Manica jako grupę rebeliantów działającą też jako zespół rockowy przemierzający planetę Mobius w poszukiwaniu swojej matki, królowej Aleenę, z którą razem będą mogli utworzyć „Radę Czworga” i obalić rządy Robotnika.
W 1996 roku dwuczęściowa seria OVA zatytułowana Sonic the Hedgehog została wydana w Japonii na VHS. Wydanie z angielskim dubbingiem połączyło razem obie części jako jeden film i zostało wydane jako Sonic the Hedgehog: The Movie przez ADV Films. W 2003 roku rozpoczęto emisję serialu Sonic X. 78-odcinkowy serial anime obrazuje zmagania Sonica, którego celem jest ochrona Szmaragdów Chaosu przed Eggmanem i nowymi złoczyńcami. Sonic X przedstawia Sonica i jego ludzkiego przyjaciela Chrisa Thorndyke'a w misji ocalenia świata, która także obejmuje podróż międzygwiezdną poprzez światy. Sonic: Night of the Werehog (pl. Sonic: Noc Jeżołaka lub Sonic: Noc Wilkojeża) z 2008 roku to film krótkometrażowy wyprodukowany przez Sega’s VE Animation Studio (dziś Marza Animation Planet) reklamujący wydanie gry Sonic Unleashed. W filmie Sonic i Chip wchodzą do nawiedzonego domu i muszą zmierzyć się z dwoma duchami usiłującymi ich przestraszyć w celu zdobycia serca dziewczyny-ducha. Sonic wystąpił też gościnnie w filmach wytwórni Walta Disneya, Ralph Demolka oraz Ralph Demolka w internecie.