Sonic Heroes (2003) przedstawia Sonica łączącego siły z Tailsem i Knucklesem, wraz z innymi drużynami postaci jak Drużyna Rose i Chaotix, przeciwko nowo odbudowanemu Metal Sonicowi, który zdradził swego pana i ma nowe zamiary dominacji nad światem. Sonic the Hedgehog (2006) przedstawia Sonica w mieście wody, „Soleannie”, gdzie musi uratować Księżniczkę Elise przed Doktorem Eggmanem, przy okazji też próbując uniknąć nowego zagrożenia na jego życie, Jeża Silvera. Jest on jedyną grywalną postacią w Sonic Unleashed (2008), gdzie wbrew woli zyskuje nową osobowość, „Sonica Jeżołaka”, będącego rezultatem Sonica połączonego z mocą Ciemnej Gai. Zyskuje siłę i elastyczność w zamian za jego szybkość, a nowy przyjaciel, dziwny stwór o imieniu Chip pomaga mu po drodze. W Sonic Colours (2010), Eggman próbuje ujarzmić energię obcych istot znanych jako „Wispy” dla promienia kontroli umysłu.