Franciszek Józef bowiem w tym czasie również poszukiwał żony. Zgodnie z planem Ludwika z córkami Heleną i Elżbietą latem pojechały na zaproszenie ciotki i kuzyna do austriackiego kurortu Bad Ischl. Podczas pierwszego spotkania młody Franciszek Józef zauroczył się jednak w piętnastoletniej wówczas Sisi,która znacząco odstawała od swojej starszej siostry obyciem w towarzystwie i płynnością konwersacji. Jak wiadomo ostatecznie to właśnie Elżbieta została cesarzową, ale pomimo to stosunki między siostrami były bardzo dobre.
Dorosłe życie W wieku 22 lat, kiedy Helenę określano już mianem „starej panny”, poznała księcia Maksymiliana Antoniego von Thurn und Taxis, którego poślubiła 24 sierpnia 1858. Para miała czworo dzieci: Luizę (ur. 1 czerwca 1859, zm. 20 czerwca 1948) Elżbietę Marię (ur. 28 maja 1860, zm. 7 lutego 1881) Maksymiliana Marię (ur. 24 czerwca 1862, zm. 2 czerwca 1885) Alberta (ur. 8 maja 1867, zm. 22 stycznia 1952)
Krótko po narodzinach ostatniego syna, w czerwcu 1867 Helena owdowiała. Jej mąż, Maksymilian Antoni zmarł w wieku 36 lat z powodu choroby nerek.