W 1939 nasiliła się penetracja rejonów przygranicznych przez niemieckie lotnictwo. Pułk wystawiał w południowo-zachodnich rejonach Polski na zagrożonych kierunkach zasadzki myśliwskie . W czerwcu jedna z eskadr towarzyszących przezbrojona została w samoloty RWD-14 „Czapla”. W czasie mobilizacji sierpniowej rozwiązano 2 pułk lotniczy, a na jego bazie powstała Baza Lotnicza nr 2. Jej komendantem został mjr obs. Władysław Popiel. Rozwiązano także 29 eskadrę towarzyszącą. Pozostałe eskadry zostały przydzielone do Armii „Kraków”, a 123 eskadra myśliwska podporządkowana została dowódcy Brygady Pościgowej.
thumb thumb thumb thumb thumb thumb
Struktura organizacyjna pułku +Dywizjony i eskadry pułkuLataDywizjonyEskadrySamolotyTypyNumery1921II dywizjon lotniczy6 eskadra wywiadowcza14 eskadra wywiadowcza1922II dywizjon wywiadowczy6 eskadra wywiadowcza14 eskadra wywiadowcza8 eskadra wywiadowczaII lotniczy batalion uzupełnieńII park lotniczy1925I dywizjon lotniczy21 eskadra lotnicza22 eskadra lotniczaII dywizjon lotniczy23 eskadra lotnicza24 eskadra lotnicza1930I dywizjon liniowy21 eskadra liniowa22 eskadra liniowaIII dywizjon myśliwski121 eskadra myśliwska122 eskadra myśliwska23 eskadra towarzysząca (pluton towarzyszący)1936I dywizjon liniowy21 eskadra liniowa22 eskadra liniowaII dywizjon liniowy24 eskadra liniowa26 eskadra