Po powrocie do miasta napotykają Mephilesa, który wskazuje im drogę, którą udał się Sonic. Silver odnajduje jeża nieopodal Radical Train i natychmiast go atakuje szybko zdobywając przewagę, tym razem ratunek przychodzi ze strony Shadowa. Zdezorientowany Silver, który bierze go za Mephilesa, nie rozumie dlaczego ten staje w obronie Sonica. Tymczasem Sonic ponownie opuszcza miejsce potyczki, a między pozostałymi dwoma jeżami dochodzi do walki. Ostatecznie Shadow wygrywa dzięki umiejętności kontroli chaosu. Shadow, który wiele podróżował w czasie i zna wiele wydarzeń wpływających na rzeczywistość, proponuje Silverowi udanie się wraz z nim do przeszłości, czasu kiedy stworzono Iblisa.
Kontrola chaosu przenosi bohaterów do laboratorium, w którym pod nadzorem naukowców przetrzymywany jest Iblis. Całemu zespołowi przewodzi ojciec Elise, książę Soleanny (ang. Duke of Soleanna). Niespodziewany, nagły wybuch w laboratorium uwalnia Iblisa i jego prawdziwego wyzwoliciela – Mephilesa, który ucieka w postaci czarnego płynu. Shadow proponuje Silverowi, aby podążył za Iblisem, on sam uda się zaś za Mephilesem. Pierwszemu z nich szybko udaje się schwytać Iblisa. Śmiertelnie ranny książę, świadomy zagrożenia, postanawia zapieczętować Iblisa w duszy swej córki Elise. Prosi jeża, aby zaopiekował się jego córką, po czym umiera.