W trybie A transponder przesyła w odpowiedzi do stacji naziemnej 12-bitowy kod (zwykle opisywany kodem ósemkowym, tj. za pomocą 4 cyfr z zakresu 0 do 7). Jest to tzw. squawk code przydzielany przez służbę kontroli ruchu lotniczego w celu identyfikacji i śledzenia. W szczególnych przypadkach kod ten może zostać ustawiony przez załogę statku powietrznego na jedną z wartości specjalnych, które oznaczają: 7700 – samolot w niebezpieczeństwie (Emergency) 7600 – awaria łączności radiowej (Communication loss) 7500 – porwanie (Unlawful interference)
W trybie C transponder przesyła w odpowiedzi informację o pułapie lotu.
Tryb S znacząco rozszerza możliwości wymiany informacji. W odróżnieniu od transpondera A/C, który często był oddzielnym urządzeniem, transponder trybu S jest swego rodzaju modemem i staje się częścią systemu, łączącym awionikę samolotu z systemami naziemnymi. Poza kodem squawk i pułapem lotu transponder trybu S może – w zależności od wyposażenia – przesłać wiele innych informacji, w tym: nazwę samolotu (np. SP-ABC) lub identyfikator lotu (Flight ID np. LOT609) informację o kategorii statku powietrznego (np.