Podobnie jak w Heroes of Might and Magic II: The Succesion Wars rozgrywka nie jest liniowa, gdyż niektóre misje są albo nieobowiązkowe, albo konieczne staje się dokonanie wyboru, którą misję należy przejść. Do wszystkich misji zostały przygotowane nowe przerywniki filmowe.
W „Cenie lojalności” gracz wciela się w lorda-zausznika władcy niewymienionego z nazwy imperium; jego zadaniem jest stłumienie buntu lorda Kruegera, który w późniejszym czasie okazuje się być kontrolowany za pomocą magii umysłu przez potężną organizację nekromantów z Ibn Fadlanem na czele. „Potomkowie” to historia dynastii, której panowanie gracz umacnia przez całą rozgrywkę, od założenia państwa przez wodza plemiennego Jarkonasa do ostatecznej rozprawy z rywalizującym przez wiele lat o wpływy królestwem Harondale. „Podróż do domu” to przygody rycerza Gallavanta, które rozpoczynają się wypadkiem na morzu i utratą statku, a kończą się na ważnym wyborze moralnym polegającym na wyborze między dochowaniu wierności swemu zwierzchnikowi – Alberonowi – i wsparciu siostry Drakonii w buncie przeciwko niemu. W „Wyspie czarodziei” gracz toczy walkę o źródło magii między frakcjami ambitnych czarodziejów.