Joanna Rutkowska (ur. 1981 w Warszawie) – polska informatyczka, ekspertka cyberbezpieczeństwa. Absolwentka Wydziału Elektroniki i Technik Informacyjnych Politechniki Warszawskiej na kierunku informatyka.
Życiorys Komputer pojawił się w jej domu, gdy była w połowie szkoły podstawowej. Programowania uczyła się wtedy z książki o języku BASIC. W 2006 roku stworzyła w firmie COSEINC zespół badawczy Advanced Malware Labs, zajmujący się nowymi metodami atakowania systemów operacyjnych i obrony przed nimi.
W sierpniu 2006 roku na konferencji Black Hat w Las Vegas zaprezentowała dwie metody ominięcia mechanizmów ochraniających system Windows Vista. Pierwsza z pokazanych metod pozwala na ominięcie testów integralności systemu Windows Vista i załadowanie do jądra kodu niepodpisanego odpowiednimi certyfikatami, a więc potencjalnie pochodzącego z niezaufanego źródła. Druga metoda jest rootkitem o nazwie Blue Pill, pozwalającym na umieszczenie działającego systemu operacyjnego w kontrolowanym przez rootkita środowisku, w sposób dla tego systemu niezauważalny, dzięki wykorzystaniu techniki wirtualizacji procesorów (hypervisor). Blue Pill wykorzystywał technologię wirtualizacji AMD SVM, znaną wcześniej pod nazwą Pacifica. Charakteryzacja tej techniki jako niewykrywalnej stała się przedmiotem kontrowersji w środowisku specjalistów.