W latach 1999–2001 zasiadał w Parlamencie Europejskim, do którego wybrano go z listy nowej partii Romano Prodiego – Demokratów. W 2001 został pokonany przez Silvia Berlusconi jako kandydat na premiera z ramienia koalicji Drzewo Oliwne. W tym samym roku powrócił do Izby Deputowanych jako poseł XIV kadencji. 24 marca 2002 razem z Demokratami przystąpił do nowej partii Demokracja to Wolność – Stokrotka, w której objął stanowisko prezydenta.
W wyborach w 2006 został deputowanym XV kadencji. W drugim rządzie Romano Prodiego objął tekę wicepremiera oraz ministra kultury i turystyki. Funkcje te pełnił przez dwa lata. W 2007 przystąpił do nowo powołanej Partii Demokratycznej.
W 2008 został senatorem XVI kadencji, obejmując kierownictwo jednej z komisji. Mandat sprawował do 2013. W 2009 odszedł z PD, powołując centrowy Sojusz dla Włoch.
Od 2004 przez kilkanaście lat był współprzewodniczącym Europejskiej Partii Demokratycznej. W 2019 został prezesem związanego z nią think tanku pod nazwą Institute of European Democrats.
Przypisy
Bibliografia Francesco Rutelli na stronie Senatu XVI kadencji Nota biograficzna na stronie prywatnej