Na początku 1996 roku Aristizábal trafił do Brazylii. Jednak jego pierwszy sezon w São Paulo FC nie był zbyt udany. Victor rozegrał ledwie 13 meczów i zdobył 5 goli, a ze swoją drużyną zajął 11. miejsce w lidze. W kolejnym sezonie jego zespół również nie odniósł sukcesu i zakończył go ledwie na 12. miejscu. W 1998 roku Kolumbijczyk przeszedł do Santos FC, gdzie grał jeszcze mniej jak w zespole São Paulo. Przez 2 sezony rozegrał ledwie 11 meczów i zdobył 2 gole i pod koniec roku wrócił do ojczyzny. W 2000 roku Aristizábal ponownie został zawodnikiem Atletico Nacional. W Kolumbii ponownie odzyskał skuteczność i zdobył 13 goli dla swojego klubu. W 2001 roku Victor grał dla Deportivo Cali. Doszedł z nim do decydującej o mistrzostwie fazy play-off, a przez cały sezon uzyskał 14 goli w lidze.
W 2002 roku Victor znów wyjechał z kraju. Został graczem Esporte Clube Vitória, z którym zajął 10. miejsce w lidze. Jeszcze przed końcem sezonu wyjechał do Kataru, do tamtejszego Al-Rajjan SC. Po grze w Katarze znów został piłkarzem brazylijskiego klubu, tym razem Cruzeiro EC. Zdobył aż 21 goli w lidze i był jednym z najskuteczniejszych zawodników swojego klubu i walnie przyczynił się do wywalczenia mistrzostwa Brazylii. W 2004 roku został piłkarzem Coritiba FBC (zajął z nią 12.