Każdy autobus ma też autokomputer pokładowy, połączenie telefoniczne z dyspozytornią oraz jest pod stałą obserwacją dzięki zamontowanym kamerom. W oparciu o system GPS, duża część przystanków wyposażonych jest w tablice informacyjne podające rzeczywisty czas przyjazdu autobusu. Na koniec 2023 roku powstał inteligentny system sterowania ruchem, dzięki któremu autobusy mają pierwszeństwo na światłach, co znacząco upłynniło ruch zbiorowej komunikacji w mieście.
MZK obsługuje 29 linii w tym 25 dziennych i 4 nocne. W ciągu miesiąca autobusy przejeżdżają około 400 tys. km. Autobusy linii dziennych kursują codziennie od 4:30 do 23:30. Autobusy linii nocnych "N1", "N2", "N3" i "N4" kursują od godziny 23:05 do 4:40. Tzw. linie priorytetowe (0, 1, 5, 8, 19) kursują w szczycie co 15 minut, reszta co pół godziny lub co godzinę.
Elektryczne autobusy 22 listopada 2017 roku zielonogórskie MZK podpisało umowę z Konsorcjum Ursus Bus i Ursus S.A na dostawę 43 fabrycznie nowych autobusów elektrycznych. Pierwszy elektryczny autobus dostarczono 17 sierpnia 2018 roku.
Oprócz elektrycznych autobusów, do Zielonej Góry przyjechało także 17 autobusów marki Mercedes z silnikami diesla.