spadek do II ligi 1997/98: 1. miejsce w II lidze, gr. wschodniej; awans do I ligi 1998/99: 15. miejsce w I lidze; spadek do II ligi; finał Pucharu Polski 1999/00: 4. miejsce w II lidze 2000/01: 8. miejsce w II lidze 2001/02: 5. miejsce w II lidze 2002/03: 4. miejsce w II lidze 2003/04: 4. miejsce w II lidze 2004/05: 2. miejsce w II lidze; awans do I ligi 2005/06: 9. miejsce w I lidze 2006/07: 2. miejsce w I lidze; finał Pucharu Ekstraklasy 2007/08: 9. miejsce w I lidze 2008/09: 5. miejsce w Ekstraklasie 2009/10: 5. miejsce w Ekstraklasie 2010/11: 10. miejsce w Ekstraklasie 2011/12: 14. miejsce w Ekstraklasie 2012/13: 16. miejsce w Ekstraklasie; spadek do I ligi 2013/14: 1. miejsce w I lidze; awans do Ekstraklasy 2014/15: 16. miejsce w Ekstraklasie; spadek do I ligi 2015/16: 16. miejsce w I lidze; spadek do II ligi 2016/17: 9. miejsce w II lidze 2017/18: 8. miejsce w II lidze 2018/19: 3. miejsce w II lidze; awans do I ligi 2019/20: 15. miejsce w I lidze 2020/21: 18. miejsce w I lidze; spadek do II ligi 2021/22: 18. miejsce w II lidze; wycofanie z II ligi po 22. kolejce 2022/23: 1. miejsce w IV lidze (jako Akademia GKS); awans do III ligi 2023/24: 4. miejsce w III lidze 2024/25: 8. miejsce w III lidze 2025/26: 16.