W dorzeczu Cisy występują kanały nawadniające do których należą: Główny Kanał Wschodni i Główny Kanał Zachodni.

Węgry mają niewiele jezior. Największe jezioro kraju – Balaton ma powierzchnię 596 km² i jest wyjątkowo płytkie, maksymalne głębokość to 11 m. Inne jeziora to: Velence, Fehér oraz Jezioro Nezyderskie, które jest akwenem granicznym z Austrią. Na obszarze Wielkiej Niziny Węgierskiej występują liczne małe jeziora słone, jednym z większych jest Fehér-tó o powierzchni 14 km². Dużym bogactwem naturalnym Węgier są wody artezyjskie oraz źródła mineralne (ponad 500 znanych), głównie są to cieplice, najliczniej występujące nad Balatonem, w Średniogórzu Zadunajskim, Budapeszcie i Średniogórzu Północnowęgierskim.

Największe rzeki i jeziora

Rzeki NazwaDługośćna WęgrzechCisa597 kmDunaj417 kmRaba188 kmZagyva179 kmHortobágy-Berettyó167 kmIpola143 kmDrawa133 kmKeresz129 kmZala126 kmSajó125 kmHornad93 kmPatrz artykuł o tej rzece.Bodrog51 kmSamosz51 kmMarusza48 kmLitawa Jeziora NazwaPowierzchniana WęgrzechPatrz artykuł o danym jeziorze.Balaton592 km²Cisa (jezioro sztuczne)127 km²Jezioro Nezyderskie75 km²Velence26 km²