Sezon 2008/2009 ukończyła na trzeciej pozycji w klasyfikacji generalnej, ustępując tylko Justynie Kowalczyk i Petrze Majdič ze Słowenii. Ponadto w klasyfikacji dystansowej była druga za Polką, a w klasyfikacji sprinterskiej zajęła piąte miejsce. Starty pucharowe zaczęła od trzeciego miejsca w biegu na 10 km stylem dowolnym w Gällivare i w większości pozostałych startów nie opuszczała pierwszej dziesiątki. Na podium plasowała się także 29 listopada w Ruce (1. - 10 km klasykiem), 6 grudnia w La Clusaz (2. - 15 km stylem dowolnym), 13 grudnia w Davos (2. - 10 km klasykiem), 24 i 25 stycznia w Otepää (2. - 10 km klasykiem i sprint klasykiem) oraz podczas trzeciej edycji TdS, którą ukończyła na drugim miejscu. Z siedmiu etapów TdS Saarinen zajęła drugie miejsce w trzecim i czwartym (Praga – sprint stylem dowolnym i Nové Město - 9 km klasykiem), a w piątym (Nové Město - sprint stylem dowolnym) i szóstym (Val di Fiemme - 10 km klasykiem) była trzecia. W klasyfikacji końcowej przegrała z Kuitunen o zaledwie 7,2 sekundy, a o ponad 27 sekund wyprzedziła trzecią Petrę Majdič. Zajęła także drugie miejsce w pierwszym etapie zawodów Finału PŚ (Sztokholm – sprint klasykiem), ale cały cykl ukończyła na szesnastej pozycji.