W meczu 33 kolejki Bundesligi sezonu 1999–2000 z Freiburgiem doszło do bardzo ciekawej sytuacji. Kontuzji uległ najpierw Georg Koch, a następnie Uwe Gospodarek i ich miejsce w bramce zajął nie kto inny, jak Michael Schjønberg. Podczas gry puścił tylko jedną bramkę, ale obronił strzał z karnego i interweniował bardzo dobrze w polu karnym, zostając prawdziwym bohaterem. 33-letni piłkarz 21 czerwca 2000 zaliczył ostatni występ w kadrze, na turnieju EURO 2000 przeciwko Czechom. Licznik gier reprezentacyjnych zatrzymał się na 44 występach. Po kolejnym sezonie zdecydował się na definitywne zakończenie kariery.
Kariera trenerska W lipcu 2003 został trenerem młodzieży w 1. FC Kaiserslautern, rok później samodzielnie trenował klub z Superligaen, Herfølge BK. Po zwolnieniu z klubu znalazł zatrudnienie, jako asystent Petera Neururera w Hanowerze. We wrześniu 2006 przejął obowiązki tymczasowego trenera tej drużyny, później zaś opiekował się zespołem rezerw. W dalszym okresie łączył obowiązki dyrektora sportowego i menedżera drugoligowego klubu z rodzimego kraju, FC Vestsjælland, a od 2013 roku jest asystentem w norweskiej Vålerenga Fotball.