Eliminacji do Mistrzostw Świata w Piłce Nożnej wyspiarze również nie mogą zaliczyć do udanych. Nie zdobyli żadnych punktów w eliminacjach do turnieju z 1994 roku, cztery lata później pokonali dwukrotnie Maltę 2:1, zdobywając sześć punktów. Następnie w eliminacjach do Mistrzostw Świata 2002 zdobyli siedem punktów, remisując ze Słowenią (2:2) i dwa razy pokonując Luksemburg (2:0, 1:0). Cztery lata później zaliczyli jedynie jeden remis 2:2 z Cyprem.
W grudniu 1999 roku Wyspy Owcze osiągnęły najwyższą w historii, 94. lokatę w rankingu FIFADane z profilu Wysp Owczych na oficjalnej stronie FIFA..
W eliminacjach do Mistrzostw Świata 2010 przegrali większość meczów – z Serbią (0:2), Rumunią (0:1) oraz Litwą (0:1). Po tych meczach trener, Jógvan Martin Olsen, zakończył współpracę z reprezentacją. Zastąpił go Irlandczyk, Brian Kerr, który trenował narodowy skład swego kraju w latach 2003–2005Brian Kerr trenerem piłkarzy Wysp Owczych..