300px|thumb|Pieczęcie Tajnego Uniwersytetu Ukraińskiego Początkowo Uniwersytet posiadał 4 wydziały: prawniczy (dziekan Maks Łewycki) filozoficzny (dziekan Iłłarion Swiencicki) medyczny (dziekan Marian Panczyszyn) techniczny (wkrótce przekształcony w Tajną Politechnikę Ukraińską)
Później doszły również wydziały: chemii oraz sztuk pięknych.
Na Tajnym Uniwersytecie studiowało w roku akademickim 1922/23 około 1500 studentów (w roku akademickim 1921/22 – 1258)Agnieszka Biedrzycka, Kalendarium Lwowa 1918–1939 , Kraków 2012, wyd. Universitas , s. 127. a liczba katedr dochodziła do 63; nieco później (1921/22) założono również Ukraińską Szkołę Politechniczną (Tajną Politechnikę Ukraińską), umożliwiającą studia kilkudziesięciu osobom. Zarówno Tajny Uniwersytet Ukraiński, jak i Tajna Politechnika Ukraińska, posiadały wspólną administrację i radę – Kuratorium Ukraińskich Wysokich Szkół, które zajmowało się również zdobywaniem funduszy na funkcjonowanie uczelni. Fundusze pochodziły głównie z darów emigracji ukraińskiej (głównie amerykańskiej), opłat studenckich, oraz z dochodów z zabaw i przedstawień studenckich.