W 2010 Klub Jagielloński im. św. Kazimierza przyznał mu wyróżnienie dla historyków zajmujących się dziejami najnowszymi w okresie III RP. W 2014 wyróżniony medalem Polonia Mater Nostra Est. W 2015 został honorowym członkiem Stowarzyszenia Studenci dla Rzeczypospolitej. Otrzymał również m.in. Nagrodę im. Jerzego Łojka, Nagrodę im. Ireny i Franciszka Skowyrów, Medal Komitetu Powązkowskiego i Medal „10 lat Instytutu Pamięci Narodowej”.
Życie prywatne Syn Stanisława i Aleksandry z domu Jankowskiej. Był ministrantem w kościele św. Aleksandra w Warszawie. Żonaty z Małgorzatą, z zawodu historyczką. Mają troje dzieci: Annę, Stanisława i Krzysztofa.
Wybrane publikacje Głębokie. Historia i zabytki (współautor z Małgorzatą Żaryn), 1992. Historia Polski do roku 1795 (współautor z Alicją Dybkowską), 1995. Polskie dzieje od czasów najdawniejszych do współczesność (współautor z Alicją Dybkowską i Małgorzatą Żaryn), 1995. Kościół a władza w Polsce. 1945–1950, 1997. Stolica Apostolska wobec Polski i Polaków w latach 1944–1958 w świetle materiałów ambasady RP przy Watykanie. Wybór dokumentów, 1998. Leszek Prorok – człowiek i twórca, 1999. Kościół w Polsce w latach przełomu (1953–1958).