Utworzenie parafii św. Bogumiła w Kole nastąpiło na mocy dekretu z 5 października 2005 r. Powstała ona z części kolskich parafii Podwyższenia Krzyża Świętego oraz Matki Bożej Częstochowskiej i obejmowała osiedla Płaszczyzna i Nagórna. Wspólnota została włączona w skład dekanatu kolskiego I, a proboszczem od 1 listopada 2005 r. został mianowany ks. Piotr Pawlak.
6 maja 2006 r. na osiedlu Nagórna została poświęcona kapliczka ku czci MB Fatimskiej, która w tej parafii obdarzana jest szczególnym kultem. Każdego miesiąca sprawowane jest stosowne nabożeństwo. Podobnym kultem otaczana jest MB Różańcowa oraz Najświętsze Serce Jezusa. 10 czerwca 2007 r., w odpust, parafia otrzymała od mieszkańców pobliskiego Dobrowa, relikwie błogosławionego Bogumiła.
10 czerwca 2008 r. bp Wiesław Mering w obecności dziekana dekanatu kolskiego I – ks. kanonika Józefa Wronkiewicza i innych kapłanów poświęcił kamień węgielny pod budowę kościoła pod wezwaniem Świętego Bogumiła.
10 czerwca 2022 roku biskup Krzysztof Wętkowski konsekrował kościół parafialny, współkonsekratorami byli biskupi seniorzy Wiesław Mering oraz Stanisław Gębicki.