ISKCON naucza zgodnie z podstawowymi zasadami hinduizmu: dusza (dżiwa, atman), w odróżnieniu od materialnego ciała jest wieczna. Ożywia ona niezliczone istoty (w tym rośliny i zwierzęta) na Ziemi i we wszechświecie. Prawo karmy i cykl samsary dotyczą wszystkich żywych istot i wynikają z ich czynności. Konsekwencją złych lub dobrych uczynków są następne wcielenia duszy. Reinkarnacja, czyli cykl kolejnych narodzin i śmierci wynika z prawa karmy. Dusza przez duchową ewolucję dąży do uwolnienia się z tego cyklu i osiągnięcia wyzwolenia (moksza). Wyzwolenie stanowi cel praktyk religijnych i najwyższy cel ludzkiego życia. Joga to określenie działań, przybliżających wyzwolenie duszy; najlepiej praktykować ją pod kierunkiem mistrza duchowego (guru). Wedy oraz inne święte pisma uzupełniające, są wieczne i objawione oraz stanowią Prawdę Absolutną.
Ponadto do najważniejszych zasad teologii należą: