Stein Huysegems (ur. 16 czerwca 1982 w Herselt) – piłkarz belgijski grający na pozycji napastnika.
Kariera klubowa Huysegems jest wychowankiem klubu Lierse SK. Do pierwszego zespołu trafił w 1998 roku, a w jego barwach zadebiutował 1 września w wygranym 3:1 meczu Superpucharu Belgii z Racingiem Genk, a miał wówczas 16 lat. Młody Stein początkowo był rezerwowym i w pierwszym sezonie gry wystąpił ledwie w 3 meczach ligowych i miał niewielki udział w zdobyciu Pucharu Belgii. Do pierwszego składu Lierse Huysegems wskoczył w sezonie 2001/2002 i grał w jednej linii z Australijczykiem Archie Thompsonem, ale to właśnie Belg był najskuteczniejszym graczem swojego zespołu (strzelił 10 bramek). Podobnie było rok później, gdy zdobył 16 goli w Eerste Klasse.
Latem 2003 Huysegemsem zainteresowali się trenerzy AZ Alkmaar i zawodnik przeszedł do tego właśnie klubu. W Eredivisie zadebiutował 14 września w zremisowanym 2:2 meczu z Feyenoordem, ale, pomimo że miał pewne miejsce w składzie, to zdobył tylko 5 goli w lidze, a z AZ zajął 6. miejsce. W sezonie 2004/2005 strzelił 7 goli, z AZ zajął 3. miejsce, a w Pucharze UEFA doszedł z nim aż do półfinałów, ale klub odpadł po dwumeczu ze Sportingiem. W sezonie 2005/2006 również strzelił 7 goli w lidze i ponownie zajął miejsce premiowane startem w Pucharze UEFA.