Koniec lat osiemdziesiątych obfitował w sukcesy juniorów i juniorów młodszych, którzy zdobywali medale na Mistrzostwach Polski na szosie oraz torze. W tym okresie, a dokładnie w 1989 roku działacze klubu zorganizowali pierwszy duży wyścig juniorów o Puchar Prezydenta Grudziądza z udziałem ekip zagranicznych. Wyścig ten rozgrywany nadal i osiągnął najwyższą kategorię Międzynarodowej Federacji UCI i jednocześnie jest corocznie umieszczany w kalendarzu tej federacji. Startują w nim najlepsi juniorzy z całej Europy, którzy w Mistrzostwach Świata juniorów zdobywali medale np. Piotr Mazur, Michaił Ignatiew, Michał Kwiatkowski. W 1991 roku w celu usamodzielnienia się od klubu sekcja podpisała umowę z Zarządem MZKS „STAL” o samofinansowaniu i od tego okresu sekcja stała się autonomiczna z własnym zarządem. Pierwszym prezesem był Jerzy Szczublewski. Początek lat dziewięćdziesiątych to powstawanie z inicjatywy Zarządu ASK Uczniowskich Klubów Sportowych w ościennych gminach powiatu grudziądzkiego. Powstanie wielu UKS-ów i dobra współpraca sekcji zaowocowała pojawieniem się coraz więcej talentów kolarskich.