Problematycznie kształtuje się klasyfikacja pomurnika w relacjach rodzinnych. Począwszy od Linneusza, przez systematyki Williama Swainsona (1837)Swainson, William: On the natural history and classification of birds, Vol. 2. 1837, London, s. 131., Hansa Friedricha Gadowa (1892)Gadow, Hans (1892): On the classification of birds, Proc. Zool. Soc., London, s. 229–256. do Aleksandra Wetmore’a (1960), naukowcy zaliczali pomurnika do pełzaczy. Taką klasyfikację zawiera m.in. wydana w latach 1931–1951 wielotomowa „Lista ptaków świata” (Checklist of Birds of the World) Jamesa Lee PetersaPeters, James L.: Checklist of Birds of the World, 7 vols., Harvard Univ. Press, 1931–1952.. Jednak już w latach 20. XX w. zwrócono uwagę na różnice fenetyczne między pomurnikiem a pełzaczamiHeinroth, Oskar i Magalene (1924–1926): Die Vögel Mitteleuropas, Berlin, vol. 1, s. 134.. Z biegiem XX w. uznanie zyskiwała klasyfikacja brytyjskich ornitologów i francusko-amerykańskiego ornitologa Charlesa Vaurie, uznająca pomurnika za jedyny gatunek w podrodzinie pomurników (Tichodromadinae) w rodzinie kowalików (Sittidae). Do tej klasyfikacji przyłączyli się także ornitolodzy z Sekcji Ornitologicznej Polskiego Towarzystwa ZoologicznegoMielczarek, Paweł i Włodzimierz Cichocki: Polskie nazewnictwo ptaków świata, w: Notatki Ornitologiczne.