Nowakowski jest autorem i redaktorem kilku książek oraz autorem wielu artykułów z zakresu problematyki społecznej i pedagogicznej – publikował m.in. w tygodniku „Echo”, „Tygodniku Solidarność”, kwartalnikach „Cywilizacja”, „Sekty i Fakty”, „Wychowawca” i „Ethos”, „Społeczeństwo i Rodzina” i „Komunikacja Publiczna”; za granicą zaś w słowackim kwartalniku „Rozmer”, ukraińskim „Visnyk“, nigeryjskim „Journal of Educational Review”, brazylijskim „Educação”, boliwijskim „Yachay” oraz amerykańskich „ICSA Today” oraz „International Journal of Arts and Sciences”.

Jest autorem haseł do Powszechnej Encyklopedii Filozofii, wydawanej w latach 2000-2009 przez Polskie Towarzystwo Tomasza z Akwinu, oraz do Małego słownika filozofii polityki, opublikowanego w 2022 roku przez Wydawnictwo von borowiecky.

Aktywność pozanaukowa W latach 2004–2008 był członkiem Rady Programowej Radia Katowice SA. Był związany z Ruchem Światło-Życie. W 2005 kandydował do Senatu w okręgu nr 30 z ramienia Ligi Polskich Rodzin, zajmując przedostatnie miejsce wśród 7 kandydatów. Posiadacz pierwszej kategorii szachowej.