Małżeństwo W 1851, w wieku 48 lat, Michał ożenił się z księżniczką Adelajdą Löwenstein-Wertheim-Rosenberg (1831–1909). Para miała siedmioro dzieci, a Michał już po swojej śmierci, nazywany był „dziadkiem Europy”. Wdowa po nim zadbała, aby ich córki wyszły za mąż za świetnie urodzonych kawalerów. Dzieci Michała i Adelajdy: Maria das Neves (1852–1941) ∞ Alfons Karol Burbon, książę San Jaime, infant Hiszpanii i karlistowski pretendent do tronu Miguel (1853–1927), książę Bragança ∞ Elżbieta Maria Thurn und Taxis ∞ Maria Teresa, księżniczka Löwenstein-Wertheim-Rosenberg Infantka Maria Teresa (1855–1944) ∞ Karol Ludwik Habsburg, arcyksiążę Austrii (trzecia żona) Maria José (1857–1943) ∞ Karol Teodor Wittelsbach, książę Bawarii (druga żona) Aldegundes (1858–1946), księżna Guimaraes ∞ Henryk Parmeński, hrabia Bardi (druga żona) Maria Anna (1861–1942) ∞ Wilhelm IV, wielki książę Luksemburga Maria Antónia (1862–1959) ∞ Robert, książę Parmy (druga żona)
Michał miał również nieślubną córkę – Marię da Assunção Carmo e Bragança (1831–1910) – ze związku z portugalską arystokratką, mieszkającą w Rzymie – Antonią Franciscą Ribeiro e Carmo. Oficjalnie uznał córkę w 1839.