Chcąc zdobyć trofeum w Le Mans, Mercedes postanowił porzucić CLK LM i skupić się na stworzeniu nowego bolidu - wyścigowy prototyp znany jako CLR stał się "sławny" dzięki spektakularnym wypadkom, a przede wszystkim "wylocie" z toru w 1999 roku.
Silniki GTR: V12 6.0l LS600
LM: V8 5.0l GT108B
Wersja cywilna
thumb|225px|left|Mercedes-Benz CLK GTR - tył thumb|225px|left|Mercedes-Benz CLK Roadster
Mercedes-Benz CLK GTR Straßenversion został zaprezentowany po raz pierwszy w 1998 roku.
Cywilny wariant CLK GTR skonstruowany został przez Mercedes-AMG przy zachowaniu minimalnych różnic wizualnych. Samochód zachował elementy zapożyczone z CLK, a także charakterystyczne, masywne nadkola i unoszone do góry drzwi. Kluczowym komponentem unikalnym dla cywilnego CLK GTR został z kolei tylny spojler zintegrowany z karoserią.
Wersje cywilne, prócz standardowego modelu z silnikiem V12 6.1L, były także wyposażone w silnik zmodernizowany przez brytyjską firmę Ilmor Engineering (6.9L). Ponadto, po przejęciu projektu przez dział Mercedesa AMG złożony z konstruktorów samochodów wyścigowych - H.W.A.