Premierowy mecz Superpucharu w nowej formule został rozegrany 22 lipca 2006 na warszawskim Stadionie Wojska Polskiego, a zmierzyły się w nim Legia oraz Wisła Płock. W derbach Mazowsza lepsi okazali się zdobywcy krajowego pucharu, zwyciężając gospodarza 2:1 (1:0).
Odmowa wzięcia udziału w meczu W kolejnej edycji Superpucharu po raz pierwszy zdarzyło się, że jedna z drużyn odmówiła udziału w spotkaniu. Na cztery dni przed wyznaczoną datą pojedynku zdobywca Pucharu Polski Dyskobolia Grodzisk Wielkopolski przesłała do Ekstraklasy SA pismo, w którym – tłumacząc się kwestiami związanymi z udziałem w Pucharze UEFA – poinformowała o rezygnacji z walki o trofeum. Zgodnie z regulaminem udział w meczu zaproponowano finaliście ówczesnej edycji Pucharu, tj. Koronie Kielce, która również nie wyraziła zainteresowania przystąpieniem do rywalizacji. Organizator zdecydował się wówczas zaprosić finalistę Pucharu Ekstraklasy – GKS Bełchatów (zdobywcą tego pucharu także była wtedy Dyskobolia).