Rok później znalazł się w kadrze Portugalii na Mistrzostwa Europy U-21.
Nigdy nie zadebiutował w seniorskiej kadrze europejskiej reprezentacji, więc w 2014 roku przyjął powołanie z kadry Maroka, która szykowała się do mającego odbyć się w tym kraju Pucharu Narodów Afryki. Debiut miał miejsce 23 maja 2014 w wygranym 4:0 towarzyskim meczu z Mozambikiem. Ostatecznie Maroko zrezygnowało z organizacji turnieju w efekcie czego zostało wykluczone z turnieju. Da Costa pojechał na kolejny turniej w 2017 roku.
W maju 2018 roku Da Costa znalazł się w 23-osobowej kadrze Maroka na Mistrzostwa Świata w piłce nożnej 2018. Na mundialu wystąpił we wszystkich meczach fazy grupowej, a Maroko nie awansowało dalej.
W 2019 roku znalazł się w kadrze na Puchar Narodów Afryki 2019.
Przypisy
Bibliografia Manuel Da Costa na whufc.pl