W odpowiedzi został wykluczony z kadry pierwszego zespołu i został zmuszony tym samym do trenowania indywidualnie. Mattia Grassani, pełnomocnik piłkarza, złożył wniosek o wszczęcie arbitrażu w tej sprawie. Piłkarz domagał się rozwiązania kontraktu. Władze ligi zarządziły zwolnienie Pandewa z kontraktu, dzięki czemu w grudniu 2009 został wolnym zawodnikiem.
4 stycznia 2010 powrócił na zasadzie wolnego transferu do Interu Mediolan. Podpisał z nim czteroipółletni kontrakt. Wraz z Interem w sezonie 2009/2010 świętował wygranie Ligi Mistrzów, wygranie mistrzostwa Włoch i Pucharu Włoch. Od 26 sierpnia 2011 do 30 czerwca 2012 był wypożyczony do SSC Napoli, a 6 czerwca 2012 został definitywnie wykupiony przez ten klub za około 7,5 miliona euro. Wraz z Napoli zdobył dwa Puchary Włoch: w sezonach 2011/2012 i 2013/2014. 1 września 2014 został piłkarzem tureckiego Galatasaray SK. W Süper Lig po raz pierwszy zagrał 13 września 2014 z Eskişehirsporem (0:0). Do gry wszedł w 76. minucie, zmieniając Buraka Yılmaza. W lidze tureckiej wystąpił czterokrotnie oraz zdobył mistrzostwo kraju. 7 lipca 2015 odszedł za darmo do Genoi CFC. 31 stycznia 2022 roku został zawodnikiem Parma Calcio 1913, a 5 lutego zadebiutował w barwach Parmy w meczu 21. kolejki Serie B z Benevento Calcio zremisowanym (0:0).