W następnym roku, po odbyciu kary, zdobył złoty medal na igrzyskach azjatyckich, a w roku 1999 – następne mistrzostwo Azji. W tym samym roku przegrał w Houston w ćwierćfinale mistrzostw świata z Savónem. Także na ćwierćfinale zakończył swój udział na olimpiadzie w Sydney (porażka z Wladimerem Czanturią).
Ukoronowaniem jego amatorskiej kariery był tytuł mistrza świata w kategorii superciężkiej, wywalczony w 2001 w Belfaście.
Chagayev jest jedynym bokserem, który dwukrotnie zdołał pokonać Félixa Savóna – najpierw dokonał tego jako 19-latek w 1997 w finale mistrzostw świata (później odebrano mu tytuł), a następnie w 1999 w finale międzynarodowego turnieju w Płowdiwie. Savón wygrał z Chagayevem tylko raz, na mistrzostwach świata w 1999.
Kariera zawodowa „Prawdziwy” debiut Chagayev w boksie zawodowym (pierwsze dwie walki stoczył w 1997) nastąpił w 2001. Chagayev stopniowo i konsekwentnie awansował w rankingach organizacji bokserskich.