Prezydent został jednak uratowany przez Ziemskie Siły Obrony, dzięki czemu organizacja ta zyskała rządowe dotacje. Na polecenie Bishopa dr Stockman stworzył substancję, która wymknęła się spod kontroli, dostała do kanałów i przez kontakt z nią Donatello zmienił się w mutanta. Część mieszkańców Nowego Jorku również została skażona. W serii piątej wraz z innymi przeciwnikami żółwi pomaga im i Splinterowi w walce z prawdziwym Shredderem. W serii Fast Forward był dobrym człowiekiem i był prezydentem. Zabójca/Król Szczurów – klon Bishopa, który na połowie twarzy ma czaszkę. Został powołany do życia przez Bishopa, by zabijał wrogów. W czwartej serii jego całe ciało było owinięte bandażami. Klony Bishopa Żołnierze Bishopa Syn Daimyo – pokonany przez Leonarda, a później połączony z Drako. Chce zemsty na Leonardo. Drako (smok który walczył z mistrzem Splinterem w Wielkiej Drace) – wielki smok połączony z synem Daimyo, chce zemsty na Splinterze. Ultimate Drako – połączeni ze sobą Drako i Syn Daimyo. Federacja – odwieczni wrogowie Triceratonów, tak jak oni chcą zdobyć Fugitoida: Generał Blanque – przywódca Federacji, arcywróg Zanramona. Żołnierze Blanque'a Triceratony – kosmiczne triceratopsy (stąd ich nazwa). Zaatakowały Ziemię, by schwytać Fugitoida.