Budowa histologiczna Ściana przełyku składa się z czterech warstw. Wymieniając od światła przełyku są to: błona śluzowa, która składa się z: nabłonka wielowarstwowego płaskiego nierogowaciejącego blaszki właściwej blaszki mięśniowej błona podśluzowa (utkanie podśluzowe) błona mięśniowa, na którą składają się dwie warstwy tkanki mięśniowej: warstwa wewnętrzna – okrężna warstwa zewnętrzna – podłużna błona zewnętrzna – przydanka.
Błona śluzowa układa się w podłużne fałdy. Nabłonek przełyku jest nabłonkiem wielowarstwowym płaskim nierogowaciejącym, tak samo jak w gardle i jamie ustnej. Blaszka właściwa jest zbudowana z tkanki łącznej właściwej, w której znajdują się nieliczne komórki i grudki limfatyczne. Blaszka mięśniowa składa się z kilku warstw komórek mięśni gładkich.
Błona podśluzowa (utkanie podśluzowe) jest zbudowana z tkanki łącznej właściwej. Gruczoły przełykowe znajdują się w błonie podśluzowej w odcinku górnym i środkowym, a w dolnym odcinku – w błonie śluzowej. Są to gruczoły śluzowe cewkowo-pęcherzykowe. Ich ujścia leżą między fałdami błony śluzowej. Wydzielany przez nie śluz, który utrzymuje nawilżenie błony śluzowej, ułatwiając pasaż pokarmu.