Następnie cerkiew była zajęta przez kościół rzymskokatolicki i mieścił się tu punkt katechetyczny, a także odprawiano nabożeństwa dla młodzieży szkolnejWłodzimierz Marczak. Ukrainiec w Polsce: Dole i niedole w PRL-u, 1994, str. 138. Tuż po zakończeniu II wojny światowej w następstwie decyzji władz państwowych, przy braku protestów kościelnej hierarchii, działalność Cerkwi greckokatolickiej zostaje w Polsce (z wyjątkiem Warszawy) zakazana, w konsekwencji czego większa część sanockiej wspólnoty greckokatolickiej przeszła do kościoła rzymskokatolickiego, inni zadeklarowali się jako niewierzący, niektórzy wreszcie przeszli na prawosławie.
Ostatni ksiądz greckokatolicki Józef Siekierzyńskiks. Józef Siekierzyński (Siekieżynśkyj Josyf, ur. w Sanoku) kanclerz AAŁ, długoletni katecheta sanocki, uczący religii młodzież greckokatolicką, założył i częściowo finansował dwutygodnik „Werchowyna”, był również jego redaktorem naczelnym [w:] Płaj: zeszyt krajoznawczy Towarzystwa Karpackiego: t. 27–29, sprawował Liturgię najpierw w kaplicy szpitalnej, a po jej zamknięciu w urządzonej za zgodą władz kościelnych kaplicy domowej do połowy 1947Zarys historii Kościoła greckokatolickiego w Polsce w latach 1944–1989, nie przeszedł na prawosławie, ale miał do tego zachęcać sanockich Ukraińców grekokatolików.