W 1929 roku na wieży zamontowano wykonany w Berlinie zegar.
Okres katolicki Po II wojnie światowej zbór ewangelicki przejęli katolicy, 1 grudnia 1946 został poświęcony jako świątynia katolicka i otrzymał wezwanie Matki Bożej Częstochowskiej, został włączony do parafii św. Jadwigi w Zielonej Górze.
5 listopada 1966 roku w kościele Matki Bożej Częstochowskiej odbyły się wspólnie dla obu ówczesnych zielonogórskich parafii – św. Jadwigi i Najświętszego Zbawiciela, obchody Milenium chrztu Polski z udziałem metropolity krakowskiego ks. arcybiskupa Karola Wojtyły i ks. bpa Juliana Groblickiego, podczas których abp Karol Wojtyła wygłosił kazanie. W uroczystości uczestniczyło ponad 15 tys. zielonogórzan.
6 listopada 1966 roku przed wyjazdem do Gorzowa Wlkp. na diecezjalne uroczystości Sacrum Poloniae Millenium, poranną niedzielną msze św. odprawił abp Karol Wojtyła, późniejszy papież i święty Kościoła katolickiego Jan Paweł II.
26 sierpnia 1987 roku biskup Józef Michalik utworzył przy kościele parafię Matki Bożej Częstochowskiej.
Przed każdą Mszą Świętą poranną odbywa się ceremonia odsłony obrazu Matki Boskiej Częstochowskiej, wzorowana na podobnej w sanktuarium na Jasnej Górze. Zasłonięcie ma miejsce po Mszy Świętej wieczornej i odśpiewaniu apelu jasnogórskiego.