W walkach obronnych pod Wysoką wśród poniesionych przez batalion strat, śmiertelne rany odniósł ppor. Władysław Markiewicz. 3 września Żywiecki batalion ON prowadził niewielkie walki, po czym wycofał się do Rabki. Podporządkowana mu została 1 kompania ON z batalionu ON „Zakopane”. Zajął obronę w rejonie Rabki. W Rabce batalion podporządkowany został dowódcy 1 pgs ppłk. Wojciecha Wójcika. 3 września batalion brał udział w ciężkich walkach opóźniających wzdłuż szosy na Mszanę Dolną. Po południu w trakcie walk o Mszanę Dolną batalion został odrzucony przez niemieckie oddziały 4 Dywizji Lekkiej wraz z II batalionem 1 pgs. Oba bataliony przebijały się na północny-wschód. W nocy 3/4 września batalion stoczył bój o wieś Słomka, ale został odrzucony w kierunku wzg.569. 5 września batalion dotarł w rejon Niegowci. Rano 6 września batalion zajął obronę w rejonie Chrostowej i wzg.305 nad wsią Stradomka. Rano 6 września w Lipnicy Murowanej został rozbity sztab 1 BGS. 6 września pod Bochnią niespodziewanym atakiem na tyły batalionu został częściowo rozproszony. Poszczególne kompanie przebijały się samodzielnie z okrążenia. 1 i 2 kompanie ON wycofywały się wraz z częścią I batalionem 2 pgs mjr. Kazimierza Czarkowskiego wraz oddziałami 21 Dywizji Piechoty Górskiej.