Kazimierza Sabatowskiego podległemu dowódcy Zgrupowania ON płk. Stanisława Siudy. Na tych stanowiskach batalion organizował obronę do 10 września.
Batalion zajmował ostatecznie stanowiska w rejonie miejscowości Chojny, z rejonu tego pododdziały batalionu prowadziły działalność patrolową. Pluton zwiadu (kolarzy) prowadził co dzień patrole docierając do Konina. I pluton 2 kompanii ON bronił mostu na Warcie i chronił tory kolejowe w kierunku Koła. Ostrowski batalion ON w składzie 3 pułku ON prowadził działania obronne i opóźniające. W godzinach wieczornych 15 września wraz z pułkiem opuścił zajmowany odcinek obrony w rejonie Długołęki i marszem ubezpieczonym skierował się w kierunku Gąbina. Rano 16 września batalion dotarł do Gąbina i zajął w pobliżu stanowiska obronne. Na batalion i cały 3 pułk ON nieprzyjaciel skierował ataki lotnictwa i ostrzał artylerii. Batalion wraz pułkiem poniósł ciężkie straty osobowe i materiałowe. Poszczególne bataliony 3 pułku ON przedzierały się nocą 16/17 września w kierunku Bzury samodzielnie. We wczesnych godzinach porannych 17 września batalion w rejonie Iłowa został zaatakowany przez lotnictwo niemieckie. W wyniku wielogodzinnego nalotu wielu żołnierzy poległo lub zostało rannych.