Brał też udział w igrzyskach olimpijskich w Atenach w 2004 roku, gdzie był czternasty indywidualnie.
Zdobył ponadto złoty medal drużynowo na mistrzostwach Europy w Płowdiwie w 1998 roku oraz srebrne w tej konkurencji na mistrzostwach Europy w Kopenhadze w 2004 roku i mistrzostwach Europy w Zalaegerszegu rok później.
Rafał Sznajder oficjalnie zakończył zawodniczą karierę podczas zawodów Pucharu Świata Młodzieżowców rozgrywanych w sosnowieckiej Hali Widowiskowo-Sportowej w dniu 13 października 2007 roku. Po zakończeniu kariery został członkiem zarządu Polskiego Związku Szermierczego, wiceprezesem Towarzystwa Miłośników Szermierki w Sosnowcu oraz sędzią międzynarodowym (m.in. sędziował zawody na igrzyskach olimpijskich w Londynie w 2012 roku).
Zmarł 13 kwietnia 2014 roku w bułgarskim mieście Płowdiw, gdzie rozgrywano mistrzostwa świata kadetów i juniorów w szermierce, na których pełnił funkcję sędziego. Prawdopodobną przyczyną śmierci był atak serca. Jego pogrzeb odbył się dziesięć dni później w kościele Nawiedzenia Najświętszej Maryi Panny w Będzinie. Został pochowany na cmentarzu w Będzinie-Małobądzu.