RC Lens Toboł Kostanaj 0–1 Dyskobolia Grodzisk Wielkopolski Austria Wiedeń 4–3 FK Jablonec 97 FC Zlaté Moravce 0–2 Zenit Petersburg Dinamo Tbilisi 0–3 Rapid Wiedeń Myllykosken Pallo-47 0–1 Blackburn Rovers F.C. Drogheda United F.C. 1–1 Helsingborgs IF Liepājas Metalurgs 3–2 AIK Fotboll Helsingin Jalkapalloklubi 2–1 Aalborg BK Ekranas Poniewież 1–1 Vålerenga Fotball Dunfermline Athletic F.C. 1–1 BK Häcken SK Brann 2–1 Sūduva Mariampol FC Haka 1–2 Midtjylland Herning Dynama Mińsk 1–1 Odense Boldklub UN Käerjéng 97 0–3 Standard Liège Hammarby IF 2–1 Fredrikstad FK
Rewanże 30 sierpnia 2007 Oțelul Gałacz 0–0 Łokomotiw Sofia Anorthosis Famagusta 0-0 CFR Cluj HŠK Zrinjski Mostar 1-2 FK Rabotnički Skopje Galatasaray SK 2-1 NK Slaven Belupo Maccabi Netanja 0-1 União Leiria UC Sampdoria 1-1 Hajduk Split Liteks Łowecz 3-0 KS Besa Kavaja Erciyesspor Kayseri 3-1 Maccabi Tel-Awiw FK Vojvodina Nowy Sad 1–2 Atlético Madryt Hapoel Tel Awiw 3-0 NK Široki Brijeg CSKA Sofia 2-1 Omonia Nikozja SV Mattersburg 0-4 FC Basel 1893 FC Sion 3-0 SV Ried FC Artmedia Petržalka 2-0 Mika Asztarak GKS Bełchatów 2-4 Dnipro Dniepropietrowsk Hamburger SV 4-0 Budapest Honvéd RC Lens 5-1 BSC Young Boys Dyskobolia Grodzisk Wielkopolski 2-0 Toboł Kostanaj FK Jablonec 97 1-1 Austria Wiedeń Zenit Petersburg 3-0 FC Zlaté Moravce Rapid Wiedeń 5-0 Dinamo Tbilisi