6 czerwca 2013 roku Fernandinho został sprzedany za 40 mln euro do Manchesteru City, z którym podpisał czteroletni kontrakt. W swoim pierwszym sezonie zdobył Puchar Ligi Angielskiej oraz mistrza Anglii, a także wystąpił w Lidze Mistrzów. Brazylijski pomocnik wystąpił w 33 meczach ligowych i strzelił w nich 5 bramek.
Kariera reprezentacyjna Fernandinho w swojej karierze występował w młodzieżowych reprezentacjach Brazylii w kategoriach U-18 i U-20. Z tą drugą w 2003 roku wziął udział w Młodzieżowych Mistrzostwach Świata. Był na nich podstawowym zawodnikiem, a w finałowym meczu z Hiszpanią zdobył jedynego gola spotkania i dzięki niemu Brazylia została mistrzem świata.
Po kapitalnym sezonie zaliczonym w Manchesterze w 2014 roku został powołany przez Luiza Felipe Scolariego do kadry na Mundial 2014 w Brazylii. 23 czerwca 2014 roku zdobył bramkę w wygranym 4:1 spotkaniu przeciwko reprezentacji Kamerunu.
Sukcesy Sukcesy klubowe 220px|thumb|Fernandinho z pucharem Ukrainy w 2011 roku. Athletico Paranaense Wicemistrzostwo Brazylii: 2004 Finalista Copa Libertadores: 2005