Flota powietrzna podzielona jest na: Północne Siły Obrony Powietrznej, główne bazy: Misawa i Aomori; Zachodnie Siły Obrony Powietrznej, główne bazy: Kasuga i Fukuoka; Centralne Siły Obrony Powietrznej, główne bazy: Iruma i Saitama); Południowo-zachodnie Siły Obrony Powietrznej, główne bazy: Naha i Okinawa. Minister Obrony Dowódca Sił Powietrznych Naczelne Dowództwo Sił Powietrznych: Fuchū, Tokio Północne Siły Obrony: Misawa, Aomori 2. Skrzydło Powietrzne (Baza Lotnicza Chitose: 201SQ=F-15 203SQ=F-15) 3. Skrzydło Powietrzne (Misawa: 3SQ=F-2 8SQ=F-4EJ) Północna Baza Ostrzegawczo-Kontrolna 3. Grupa Obrony Rakietowej 6. Grupa Obrony Rakietowej Centralne Siły Obronne: Iruma, Saitama 6. Skrzydło Powietrzne (Baza Lotnicza Komatsu: 303SQ=F-15 306SQ=F-15) 7. Skrzydło Powietrzne (Baza Lotnicza Hyakuri: 204SQ=F-15 305SQ=F-15) Centralna Baza Ostrzegawczo-Kontrolna 1. Grupa Obrony Rakietowej 4. Grupa Obrony Rakietowej Iwo Jima Grupowa Baza Powietrzna Zachodnie Siły Obronne: Kasuga, Fukuoka 5. Skrzydło Powietrzne (Baza Lotnicza Nyutabaru: 301SQ=F-4EJ) 8. Skrzydło Powietrzne (Baza Lotnicza Tsuiki: 304SQ=F-15 6SQ=F-2) Zachodnia Baza Ostrzegawczo-Kontrolna 2. Grupa Obrony Rakietowej Południowo-Zachodnie Siły Powietrzne: Naha, Okinawa 83.