Farmacja weterynaryjna – dział farmacji zajmujący się lekami przeznaczonymi do stosowania u zwierząt domowych (psy, koty, ptaki, gryzonie, konie itp.) i gospodarskich (krowy, świnie, owce itp.), a także egzotycznych i dziko żyjących w celu leczenia, profilaktyki i diagnozowania chorób. Przedmiot farmacji weterynaryjnej jest objęty w programie nauczania jednolitych studiów magisterskich dziennych na wydziałach medycyny weterynaryjnej akademii rolniczych, kierunku studiów weterynarii.
thumb|200px|Symbol lekarza weterynarii thumb|200px|Symbol farmacji-moździerz z pistlem
Farmacja weterynaryjna zajmuje się między innymi następującymi zagadnieniami: ustawodawstwem weterynaryjnym dotyczącym leków dla zwierząt; farmakologią weterynaryjną (działanie, kinetyka, dynamika i stosowanie farmaceutycznych produktów weterynaryjnych); toksykologią weterynaryjną; różnymi aspektami doświadczeń przeprowadzanych na zwierzętach; produkcją leków w oparciu o Farmakopeę Weterynaryjną; obrotem lekami weterynaryjnymi; badaniami i kontrolą jakości leków przeznaczonych dla zwierząt; monitorowaniem niepożądanych działań produktów leczniczych weterynaryjnych w celu zapewnienia bezpieczeństwa zwierzętom, bezpieczeństwa żywności pochodzenia zwierzęcego, bezpieczeństwa ludzi stykających się z lekami weterynaryjnymi i bezpieczeństwa środowiska