Życie prywatne Spotykał się z Peggy Trentini, Nicole, Kimberly Foster (1985), Hilary Edson (1985-86) i Laurie Landry (1987). 18 grudnia 1993 poślubił aktorkę Kristinę Crump, z którą poznał na planie Szpitalu miejskiego, gdzie grała Felicię Cummings. Mieli dwóch synów: Petera (ur. 4 września 1990) i Harrisona (ur. 1 grudnia 1994 zm. 6 czerwca 2022). Jednak w 2006 doszło do rozwodu. W latach 1999–2000 spotykał się z aktorką Coleen Sexton, z którą grał w musicalu Jekyll & Hyde.
Od roku 2007 spotykał się z Heather Locklear, jednak w sierpniu 2011 roku jego zaręczyny zostały zerwane. Wagner odnalazł swoją nieślubną córkę, Kerry. Matka dziewczyny poinformowała aktora o dziecku dopiero po urodzeniu i oddaniu do adopcji. Jack spotkał się z córką po raz pierwszy, 4 listopada 2011 roku, na koncercie aktora, na Florydzie. W maju 2012 spotykał się z Ashley Jones (Bridget Forrester z Mody na sukces).
Filmografia Filmy fabularne 1990: Zagraj mordercę dla mnie (Play Murder for Me) jako Paul Slater 1994: Złapany w pułapkę w kosmosie (Trapped in Space) jako MacNeil 2000: Sztuczne kłamstwa (Artificial Lies) jako dr Peter Rexter 2002: Cupid’s Prey jako Jeremy Wetherton