Był szanowanym lingwistą. Studiował literaturę starożytną, Biblię, przede wszystkim Nowy Testament. Zorganizował wyprawy archeologiczne do Karkemisz i Ur. Jeszcze po przejściu na emeryturę przyczynił się do zdobycia Kodeksu Synajskiego oraz do publikacji papirusów Chester Beatty, wnosząc tym wkład w poświadczenie autentyczności Nowego Testamentu. W książce Our Bible and the Ancient Manuscripts z 1895 wykazywał, iż egipskie papirusy i odkrycia archeologiczne mogą potwierdzić historyczność zdarzeń opisanych w Ewangeliach. W książce The Story of the Bible napisał: Pismo Święte, natchnione od Boga, ma też swoje dzieje wśród ludzi. Dzieje te są nadzwyczaj ciekawe i powinien je znać każdy, kto ceni swą Biblię. (...) Jakież to pokrzepiające, gdy się w końcu stwierdza, że wszystkie te odkrycia i studia w gruncie rzeczy poświadczają autentyczność Pisma Świętego i umacniają nas w przekonaniu, że trzymamy w ręku nienaruszone co do swej istoty, prawdziwe Słowo Boże.
Jego najstarsza córka Kathleen Kenyon również została archeologiem.