Markus Pröll (ur. 28 sierpnia 1979 w Rheinbach) – niemiecki piłkarz występujący na pozycji bramkarza.
Kariera Pröll karierę rozpoczynał w wieku 6 lat w VfR Flamersheim. Potem trenował w Eintrachcie Lommersum, a w 1995 roku trafił do juniorskiej ekipy 1. FC Köln. W sezonie 1998/1999 został włączony do jego pierwszej drużyny, grającej w 2. Bundeslidze. W tych rozgrywkach zadebiutował 30 października 1998 w przegranym 0:1 meczu ze Stuttgarter Kickers. Od czasu debiutu Pröll stał się podstawowym graczem 1. FC Köln. W sezonie 1999/2000 zajął z klubem 1. miejsce w lidze i awansował z nim do Bundesligi. W tej lidze pierwszy występ zanotował 13 sierpnia 2000 przeciwko FC Schalke 04 (1:2). W sezonie 2001/2002 uplasował się z klubem na 17. pozycji w Bundeslidze i spadł z nim do 2. Bundesligi. Od początku następnego sezonu stracił się w podstawowym składzie na rzecz Alexandera Bade. Na koniec tamtego sezonu 1. FC Köln awansowało do Bundesligi, a Pröll odszedł z klubu.