Wrócił wówczas do Głównego Urzędu Statystycznego, gdzie w Wydziale Statystyki Społecznej pracował do wybuchu wojny.

Od rozpoczęcia okupacji niemieckiej w Polsce w 1939 nadal działał w konspiracyjnym Instytucie Gospodarstwa Społecznego. W tym czasie opracował wraz z innymi autorami program gospodarczy Polskiej Partii Socjalistycznej. Współpracował z Biurem Informacji i Propagandy Komendy Głównej AK, sporządzając cykliczne analizy ekonomiczne dotyczące sytuacji gospodarczej Polski i Niemiec.

W okresie okupacji niemieckiej napisał, będącą po zakończonej II wojnie światowej wartościowym źródłem informacji o realiach wojny, Kronikę lat wojny i okupacji (tom 1–3, Warszawa 1962–1963). W latach 1940–1942 działał w konspiracji jako redaktor pisma Kronika Okupacji, wydawanego przez WRN (organizację podziemną PPS, Wolność, Równość, Niepodległość). 29 lutego 1944 został aresztowany przez Gestapo w Warszawie, prawdopodobnie niedługo potem zamordowany. Następnego dnia Niemcy aresztowali jego żonę i córkę; obie zażyły truciznę;